С начала 90-х годов в России началась активная работа по институционализации профессии самоорганизации консультантов по управлению через различные формы. Было создано несколько ассоциаций консультантов, принимались различные документы, регламентирующие работу консультантов и определяющие их этические нормы, появились первые учебные программы для консультантов по управлению (например, Школа консультантов по управлению РАНХиГС).
«Национальный институт сертифицированных консультантов по управлению» (НИСКУ) был образован в 2003 году как некоммерческое научно-практическое сертифицирующее партнёрство, когда выиграл конкурс на право вхождения от России в Международный совет институтов управленческого консультирования (ICMCI) после соответствующего аудита и двухлетнего испытательного стажа.. Так мы получили право сертификации консультантов по управлению по стандарту этого Совета. Тогда же три первых российских консультанта прошли сертификацию на конгрессе ICMCI в Стамбуле. Основателем, одним из соучредителей и первым президентом НИСКУ стал д.ф.н., проф. Аркадий Ильич Пригожин. Институт являлся продолжателем традиций российской Ассоциации консультантов по управлению и организационному развитию (АКУОР).
В 2003 г. с организационным участием НИСКУ в Москве прошла международная конференция ICMCI. Примерно тогда же Российский оргкомитет провёл в Петербурге конгресс Международной ассоциации организационного развития (IODA).
В 2005 году в НИСКУ прошла первая сертификация консультантов по управлению: Штермана А., Шустермана Д., Лобановой Т., Раздорской М., Кулижского А., Гусаковского А., Невраевой И., Смоленцева К. Президентом НИСКУ был избран А.И.Пригожин, СМС, руководитель Школы консультантов по управлению.
В 2006-2009 годах в Москве, в Академии народного хозяйства прошли первые конференции консультантов НИСКУ. На них выступали известные российские и международные экономисты, управленцы, консультанты: ректор АНХ при Правительстве РФ, профессор В.А. Мау, Президент «Казинвест» Б.Копбаева, академик Российской Академии Наук , главный редактор журнала «Стратегические инициативы», Института экономических стратегий Агеев А.И., доктор экономических наук, главный научный сотрудник Института народнохозяйственного прогнозирования РАН Яков Паппэ. Большой интерес всегда вызывали проблемные выступления президента НИСКУ А.И.Пригожина.
С 2010 года возникла практика обмена на конференциях консультационными разработками между консультантами – членами НИСКУ. На конференциях 2010 – 2011 года, проходивших в Москве выступили: президент Института развития территорий, член Общественной палаты РФ Глазычев В. Л., руководитель отдела социокультурных исследований «Левада-центр» Левинсон А.Г., президент консалтинговой компании PMTeam М.Вишнякова, депутат Госдумы РФ трёх созывов, президент Фонда поддержки законодательных инициатив Г.А.Томчин, известный консультант, автор многочисленных книг о консалтинге И.Альтшулер.
В 2012 году президентом НИСКУ избран один из учредителей НИСКУ, СМС Иванов М.А. По его приглашению на конференциях НИСКУ в 2012-2013 гг. выступили президент Международного Совета институтов консультантов по управлению (ICMCI) Франческо Д”Априле (Италия) и представитель Европейского банка реконструкции и развития в области развития консультирования в России Дилек Масит.
В 2013 году начал работать совместный семинар НИСКУ и Института философии РАН «Качество управления социотехническими системами» под руководством президента НИСКУ Иванова М.А.
С 2013 года летние конференции НИСКУ стали проходить в регионах. Первая такая конференция прошла в Томске. Перед участниками выступил зам.губернатора Томской области по инновациям А.Князев. Также на традиционные московские конференции приглашались с выступлениями: директор Института глобализации и социальных движений Б.Ю.Кагарлицкий, начальник Отдела стратегического развития Министерства экономики РФ Тарасенко В.В., руководитель направления макро-экономики Центра макроэкономического анализа и краткосрочного прогнозирования, заведующий лабораторией Института народнохозяйственного прогнозирования РАН, д.э.н. Белоусов Д.Р., директор Российского Института Директоров, к.и.н. Беликов И.В., д.п.н., профессор МГУ Базаров Т.Ю.
В 2014 году президентом НИСКУ был избран СМС Лобуков В.Г. Каждая конференция сопровождалась публичными сертификациями консультантов по управлению.
В 2014 году прошла летняя конференция консультантов НИСКУ в Иркутске. Среди выступающих был директор по персоналу Иркутскэнерго, генеральный директор ИКФ «Альт» (Санкт-Петербург) и другие.
В 2015 году летняя конференция консультантов Ниску прошла в Челябинске. Среди выступающих на конференции были: декан Международного факультета ЮУрГУ Горшенин В.П.,директор «Завод «Прибор», президент Ассоциации предприятий ОПК Челябинской области Мухаметшин Р.Ф., сертифицированный консультант, руководитель сообщества СМС США, управляющий партнер КК "APT Facilitators" Оливер Матар (США). На традиционной московской зимней конференции выступали вице-президент по корпоративному развитию компании Евразия Дриллинг Компании, в прошлом генеральный директор КК «ПАКК» С.Романенко, управляющий партнер консультационной компании «АЛЬТ» А.Груздев.
В 2016 году президентом НИСКУ избран Елисеев С. Одним из новых форматов московских конференций НИСКУ стало посещение участниками крупных консалтинговых компаний - IBS (Information Business Systems), «PricewaterhouseCoopers», «ЭКОПСИ Консалтинг».
В 2016 году конференция НИСКУ впервые прошла в Татарстане (г.Казань). Перед участниками выступили зам. Генерального директора по работе с резидентами «ОЭЗ Алабуга», начальник управления по работе с персоналом отделения «Банк Татарстан» Сбербанка, международный консультантЛузин А. (Женева).
В 2017 году прошла первая совместная конференция НИСКУ и Московской торгово-промышленной палаты. С участниками конференции делились опытом президент Ассоциации консалтинговых компаний (АСКОНКО), президент Северо-Западного центра корпоративного управления, руководитель кафедры Теории Менеджмента и бизнес-технологий РЭУ им Г.В. Плеханова, топ-менеджеры и бизнесмены, участники программы «Кадровый резерв» и др.
В 2018 году на зимней конференции НИСКУ также были организованы экскурсии в офисы крупнейших российских консалтинговых компаний Консист и BDO.
В 2019 году президентом НИСКУ избран СМС Вахин А. Были проведены стратегические сессии консультантов НИСКУ в Москве и Красной поляне.
В 2020 году президентом НИСКУ избрана СМС, доц. НИУ ВШЭ, к.п.н. Лобанова Т.Н. Совет НИСКУ также начал работу в обновленном составе.